Добрый день!
Согласно положений ст.19.1 Закона РФ «О таможенном тарифе»при определении таможенной стоимости ввозимых товаров по методу по стоимости сделки с ввозимыми товарами к цене, фактически уплаченной или подлежащей уплате за эти товары, должны быть дополнительно начислены расходы по перевозке (транспортировке) товаров до аэропорта, морского порта или иного места прибытия товаров на таможенную территорию Российской Федерации, если такие расходы ранее не были включены в контрактную стоимость товара.
Как следует из содержания Вашего вопроса, Вы как покупатель, заплатили штраф перевозчику за ненадлежащее исполнение обязательств по договору перевозки (простой машин). То есть, для Вас, как покупателя товара, возникли дополнительные расходы, связанные с перевозкой товаров до границы РФ. Исходя из чего, таможня вполне обоснованно требует включить расходы, в виде штрафов, в таможенную стоимость товара, при данных условиях поставки.

С Уважением. Специалист по таможенным спорам, к.ю.н.
Андрей Бернев.
Отредактировано согласно правилам